Cedera Ginjal Akut di antara orang Afrika-Amerika dengan Ciri dan Penyakit Sel Sabit

Mutasi SARS-CoV-2 tampaknya tidak meningkatkan penularan

[ad_1]

Newswise – Tidak ada mutasi yang saat ini didokumentasikan dalam virus SARS-CoV-2 yang tampaknya meningkatkan penularannya pada manusia, menurut sebuah penelitian yang dipimpin oleh para peneliti UCL.

Analisis genom virus dari lebih dari 46.000 orang dengan COVID-19 dari 99 negara diterbitkan hari ini di Komunikasi Alam.

Penulis pertama dan terkait Dr Lucy van Dorp (Institut Genetika UCL) mengatakan: “Jumlah genom SARS-CoV-2 yang dihasilkan untuk penelitian ilmiah sangat mengejutkan. Kami menyadari sejak awal pandemi bahwa kami membutuhkan pendekatan baru untuk menganalisis sejumlah besar data mendekati waktu nyata untuk menandai mutasi baru pada virus yang dapat memengaruhi penularan atau keparahan gejalanya.

“Untungnya, kami menemukan bahwa tidak satu pun dari mutasi ini yang membuat COVID-19 menyebar lebih cepat, tetapi kami perlu tetap waspada dan terus memantau mutasi baru, terutama saat vaksin diluncurkan.”

Coronavirus seperti SARS-CoV-2 adalah jenis virus RNA, yang semuanya dapat mengembangkan mutasi dalam tiga cara berbeda: karena kesalahan penyalinan selama replikasi virus, melalui interaksi dengan virus lain yang menginfeksi sel yang sama (rekombinasi atau reassortment), atau mereka dapat diinduksi oleh sistem modifikasi RNA pejamu yang merupakan bagian dari imunitas pejamu (misalnya sistem kekebalan tubuh seseorang).

Kebanyakan mutasi bersifat netral, sementara yang lain menguntungkan atau merugikan bagi virus. Baik mutasi netral dan menguntungkan bisa menjadi lebih umum saat diturunkan ke virus keturunan.

Tim peneliti dari UCL, Cirad dan Université de la Réunion, dan Universitas Oxford, menganalisis kumpulan data global genom virus dari 46.723 orang dengan COVID-19, dikumpulkan hingga akhir Juli 2020.

Para peneliti sejauh ini telah mengidentifikasi 12.706 mutasi pada SARS-CoV-2, virus penyebab COVID-19. Untuk 398 mutasi, terdapat bukti kuat bahwa hal itu terjadi berulang kali dan secara independen. Dari jumlah tersebut, para peneliti mengasah 185 mutasi yang telah terjadi setidaknya tiga kali secara independen selama pandemi.

Untuk menguji apakah mutasi meningkatkan penularan virus, para peneliti membuat model pohon evolusi virus, dan menganalisis apakah mutasi tertentu menjadi semakin umum dalam cabang tertentu dari pohon evolusi – yaitu, menguji apakah, setelah mutasi pertama kali berkembang di virus, keturunan dari virus itu mengungguli virus SARS-CoV-2 yang terkait erat tanpa mutasi khusus itu.

Para peneliti tidak menemukan bukti bahwa salah satu mutasi umum meningkatkan penularan virus. Sebaliknya, mereka menemukan mutasi yang paling umum adalah netral untuk virus. Ini termasuk satu mutasi pada protein lonjakan virus yang disebut D614G, yang telah banyak dilaporkan sebagai mutasi umum yang dapat membuat virus lebih mudah menular. Bukti baru menemukan bahwa mutasi ini sebenarnya tidak terkait dengan peningkatan penularan secara signifikan.

Para peneliti menemukan bahwa sebagian besar mutasi umum tampaknya disebabkan oleh sistem kekebalan manusia, daripada hasil adaptasi virus dengan inang manusia yang baru. Situasi ini berbeda dengan analisis lain oleh tim yang sama tentang apa yang terjadi ketika SARS-CoV-2 kemudian melompat dari manusia ke cerpelai peternakan.

Dr van Dorp berkata: “Ketika kami menganalisis genom virus yang bersumber dari cerpelai, kami kagum melihat mutasi yang sama muncul berulang kali di peternakan cerpelai yang berbeda, meskipun mutasi yang sama jarang diamati pada manusia sebelumnya.”

Penulis utama Profesor Francois Balloux (Institut Genetika UCL) menambahkan: “Kami mungkin telah melewatkan periode adaptasi awal virus ini pada manusia. Kami sebelumnya memperkirakan SARS-CoV-2 melompat ke manusia pada Oktober atau November 2019, tetapi genom pertama kami memiliki tanggal hingga akhir Desember. Pada saat itu, mutasi virus yang penting untuk penularan pada manusia mungkin telah muncul dan menjadi tetap, menghalangi kami untuk mempelajarinya. “

Hanya diharapkan bahwa virus akan bermutasi dan akhirnya menyimpang ke dalam garis keturunan yang berbeda karena menjadi lebih umum pada populasi manusia, tetapi ini tidak berarti bahwa setiap garis keturunan yang lebih dapat ditularkan atau berbahaya akan muncul.

Dr van Dorp berkata: “Virus tampaknya beradaptasi dengan baik untuk penularan di antara manusia, dan mungkin sudah mencapai kebugaran optimal di tubuh manusia pada saat itu diidentifikasi sebagai virus baru.”

Para peneliti memperingatkan bahwa pengenalan vaksin dalam waktu dekat kemungkinan akan memberikan tekanan selektif baru pada virus untuk menghindari pengenalan oleh sistem kekebalan manusia. Hal ini dapat menyebabkan munculnya mutan yang lolos dari vaksin. Tim tersebut menekankan bahwa kerangka komputasi yang mereka kembangkan harus terbukti berguna untuk identifikasi tepat waktu dari kemungkinan mutasi lolos dari vaksin.

Profesor Balloux menyimpulkan: “Berita di bagian depan vaksin tampak hebat. Virus mungkin saja memperoleh mutasi lolos dari vaksin di masa depan, tetapi kami yakin kami akan dapat segera menandai mereka, yang akan memungkinkan pembaruan vaksin di waktu jika diperlukan. “

###


Diposting Oleh : https://totohk.co/

About the author