Cedera Ginjal Akut di antara orang Afrika-Amerika dengan Ciri dan Penyakit Sel Sabit

Analisis proteogenomik multisenter berskala besar yang pertama menawarkan wawasan baru tentang biologi tumor otak pediatrik


Newswise – New York, NY (25 November 2020) – Analisis “proteogenomik” komprehensif dari protein, gen, dan transkripsi RNA yang terlibat dalam tumor otak anak telah menghasilkan pemahaman yang lebih lengkap tentang tumor ini, yang merupakan penyebab utama kanker kematian terkait pada anak-anak. Hasilnya dapat membantu dokter mengidentifikasi jenis tumor dengan lebih akurat dan metode pengobatannya.

Para peneliti dari Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium (CPTAC) dan Children’s Brain Tumor Network (CBTN) mengumpulkan dan menganalisis apa yang dikenal sebagai data genetik, genomik, dan proteomik dari berbagai jenis tumor otak pada anak-anak. Konsorsium tersebut terdiri dari kolaborator dari Icahn School of Medicine di Mount Sinai, National Cancer Institute, Fred Hutchinson Cancer Research Center, Children’s National Hospital, dan Children’s Hospital of Philadelphia. Studi tersebut, studi multicenter skala besar pertama yang berfokus pada tumor otak anak, tersedia secara online di Sel pada 25 November.

“Kanker anak pada umumnya, dan tumor otak anak pada khususnya, memiliki beban mutasi yang relatif rendah,” jelas Pei Wang, PhD, penulis utama studi tersebut dan Profesor Ilmu Genetika dan Genomik di Sekolah Kedokteran Icahn di Gunung Sinai. “Karenanya, karakterisasi komprehensif dari biologi molekuler fungsional tumor ini, termasuk analisis proteogenomik yang dilakukan dalam penelitian ini, sangat penting untuk lebih memahami dan mengobati tumor otak anak.”

Studi ini adalah survei komprehensif genomik pertama (yang bertujuan untuk mengkarakterisasi perubahan urutan DNA dalam sampel), transkriptomik (yang bertujuan untuk mengukur salinan RNA), proteomik global (yang bertujuan untuk mengidentifikasi dan mengukur protein), dan fosfoproteomik (yang mengukur protein aktif) di seluruh kohort besar yang terdiri dari 218 sampel tumor yang mewakili tujuh jenis tumor otak yang berbeda.

Dengan mengkarakterisasi tema biologis yang dibagi di antara berbagai jenis tumor ini, penelitian tersebut mengungkapkan wawasan baru yang menunjukkan bahwa pengobatan saat ini yang digunakan untuk jenis tumor tertentu dapat diterapkan pada orang lain yang memiliki fitur proteomik yang sama. Secara khusus, analisis mengungkapkan dua subkelompok berbeda dari kraniofaring pediatrik, sejenis tumor otak anak. Satu subkelompok menunjukkan karakteristik proteomik / fosfoproteomik yang sangat mirip dengan jenis tumor lain, yang dikenal sebagai “glioma tingkat rendah (LGG) dengan mutasi BRAFV600E.” Pengamatan ini menunjukkan bahwa penghambat MEK / MAPK, sejenis kemoterapi yang telah digunakan untuk melawan tumor mutasi LGG-dengan-BRAFV600E, mungkin juga membantu subset kraniofaringioma pediatrik, yang saat ini tidak memiliki pilihan kemoterapi yang kuat.

“Pendorong studi bersama ini adalah komitmen untuk berbagi data dan sains terbuka. Bekerja sama telah memberi CPTAC dan CBTN kesempatan untuk memperluas sumber daya yang tersedia untuk menjawab pertanyaan biologis yang sangat penting. Memanfaatkan keahlian kolektif di seluruh konsorsium ini memungkinkan kami untuk lebih memahami mekanisme tumor pediatrik, meningkatkan proses identifikasi protein target, dan berpotensi meningkatkan perawatan kanker, ”kata Adam Resnick, PhD, peneliti yang berkontribusi, Co-Chair Ilmiah untuk CBTN, dan Direktur Center for Data Driven Discovery in Biomedicine (D3b) di Rumah Sakit Anak Philadelphia.

Dengan memanfaatkan data hasil klinis yang kaya dari kohort ini, tim peneliti juga mengidentifikasi biomarker prognostik baru untuk jenis tumor yang dikenal sebagai glioma tingkat tinggi (HGG). Ketika tumor HGG memiliki mutasi genetik yang dikenal sebagai a H3K27M mutasi, mereka cenderung sangat agresif dan waktu kelangsungan hidup pasien relatif singkat. Namun, pada mereka yang tidak mengalami mutasi, penelitian ini menunjukkan bahwa kelimpahan protein bernama IDH1 dan IDH2 dalam jaringan tumor dapat membantu mengidentifikasi tumor mana yang tidak bermutasi. H3K27M gen mungkin kurang agresif.

“Integrasi data klinis, proteomik, dan genetik yang dihasilkan dalam studi ini memungkinkan kami untuk membangun model biologi tumor otak yang lebih komprehensif, yang akan mengarah pada perawatan yang lebih bertarget,” kata Brian Rood, MD, peneliti yang berkontribusi, Executive Co-Chair untuk CBTN, dan Direktur Medis Institut Tumor Otak di Rumah Sakit Nasional Anak.

Analisis data juga menunjukkan perbedaan biologis utama dalam sampel dari tumor primer dan tumor rekuren dari pasien yang sama, yang menunjukkan perlunya penilaian independen dan keputusan terapeutik untuk tumor ini.

“Studi saat ini adalah yang pertama mengungkapkan pada tumor otak pediatrik kekuatan protein untuk lebih menentukan pasien mana yang mungkin mendapat manfaat dari terapi yang diberikan, dan studi validasi kami menggunakan proteomik bertarget menyediakan platform untuk implementasi klinis dari temuan tersebut” kata rekan penulis Amanda Paulovich, MD, PhD, Aven Foundation Endowed Chair dan profesor di Divisi Riset Klinis di Fred Hutchinson Cancer Research Center. “Saat pekerjaan ini bergerak lebih jauh ke arah validasi klinis, saya harap ini membawa kenyamanan bagi pasien dan keluarga mereka yang menderita penyakit mengerikan ini.”

Tentang Sistem Kesehatan Gunung Sinai

Sistem Kesehatan Mount Sinai adalah sistem medis akademik terbesar di Kota New York, mencakup delapan rumah sakit, sekolah kedokteran terkemuka, dan jaringan luas praktik rawat jalan di seluruh wilayah New York yang lebih besar. Mount Sinai adalah sumber nasional dan internasional untuk pendidikan tak tertandingi, penelitian dan penemuan translasi, dan kepemimpinan klinis kolaboratif yang memastikan bahwa kami memberikan perawatan dengan kualitas tertinggi — dari pencegahan hingga pengobatan penyakit manusia yang paling serius dan kompleks. Sistem Kesehatan mencakup lebih dari 7.200 dokter dan memiliki jaringan layanan multispesialis yang kuat dan terus berkembang, termasuk lebih dari 400 lokasi praktik rawat jalan di seluruh lima wilayah di New York City, Westchester, dan Long Island. Rumah Sakit Mount Sinai berada di peringkat ke-14 Berita AS & Laporan Dunia “Honor Roll” dari 20 Rumah Sakit Terbaik di negeri ini dan Sekolah Kedokteran Icahn sebagai salah satu dari 20 Sekolah Kedokteran Terbaik di negeri ini. Rumah sakit Sistem Kesehatan Mount Sinai secara konsisten diperingkat secara regional berdasarkan spesialisasi dan dokter kami berada di 1% teratas dari semua dokter secara nasional menurut Berita AS & Laporan Dunia.

Untuk informasi lebih lanjut, kunjungi https://www.mountsinai.org atau temukan Gunung Sinai di Facebook, Indonesia dan YouTube.


Diposting Oleh : http://54.248.59.145/

About the author